1、有机大米在生产加工过程中绝对禁止使用农药、化肥、激素等人工合成物质，并且不允许使用基因工程技术；普通大米则没有这些限制。
2、有机大米在土地生产转型方面有严格规定，考虑到某些物质在环境中会残留相当一段时间，土地从生产其它食品到生产有机大米需要两到三年的转换期，而普通大米则没有转换期的要求。
3、有机大米在数量上进行严格控制，要求定地块、定产量，生产普通大米没有如此严格的要求。
4、按照国际惯例，有机食品标志认证一次有效许可期为一年，一年期满后可申请“保证认证”，通过检查、审核合格后方可继续使用有机食品标志。
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